Certaines hypothèses astronomiques à l`époque (comme les épicycles et les excentriques) étaient considérées comme de simples instruments mathématiques pour ajuster les calculs de l`endroit où les corps célestes apparaîtront, plutôt qu`une explication de la cause de ces motions. (Comme Copernic maintenait toujours l`idée d`Orbits parfaitement sphériques, il comptait sur les épicycles.) Cette «sauvegarde des phénomènes» a été considérée comme la preuve que l`astronomie et les mathématiques ne pouvaient pas être considérés comme des moyens sérieux pour déterminer les causes physiques. Tolosani a invoqué cette opinion dans sa critique finale de Copernic, en disant que sa plus grande erreur était qu`il avait commencé avec des champs «inférieurs» de la science pour faire des déclarations sur les champs «supérieurs». Copernic avait utilisé les mathématiques et l`astronomie pour postuler sur la physique et la cosmologie, plutôt que de commencer par les principes acceptés de la physique et de la cosmologie pour déterminer les choses sur l`astronomie et les mathématiques. Ainsi, Copernic semblait miner l`ensemble du système de la philosophie de la science à l`époque. Tolosani a jugé que Copernic était tombé dans l`erreur philosophique parce qu`il n`avait pas été versé dans la physique et la logique; n`importe qui sans une telle connaissance ferait un pauvre astronome et être incapable de distinguer la vérité du mensonge. Parce que le Copernicanisme n`avait pas satisfait aux critères de la vérité scientifique énoncés par Thomas Aquinas, Tolosani a statué qu`il ne pouvait être considéré comme une théorie sauvage non prouvée. [122] 123 la réputation de Copernic en dehors des cercles polonais locaux en tant qu`astronome d`une capacité considérable est évidente du fait que, en 1514, il a été invité à donner son avis au cinquième Concile de Laresque de l`église sur le problème critique de la réforme du calendrier. Le calendrier civil alors utilisé était encore celui produit sous le règne de Jules César, et, au cours des siècles, il était tombé sérieusement hors de l`alignement avec les positions réelles du soleil. Cela a rendu les dates des jours de fête cruciaux, comme Pâques, très problématique. Si Copernicus n`a jamais offert de point de vue sur la façon de réformer le calendrier n`est pas connu; en tout état de cause, il n`a jamais assisté à aucune des sessions du Conseil.

Le premier réformateur du calendrier était Paul de Middelbourg, évêque de Fossombrone. Lorsque Copernic composa son dévouement à de révolutionnaire Onibus en 1542, il remarqua que «les mathématiques sont écrites pour les mathématiciens». Ici, il distingua entre ceux, comme Paul, dont les capacités mathématiques étaient assez bonnes pour comprendre son travail et d`autres qui n`avaient aucune capacité de ce genre et pour qui son travail n`était pas destiné.